MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015942	TGG	2	6	69292	69297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198300
1502	NC_015942	T	6	6	69322	69327	0 %	100 %	0 %	0 %	344198300
1503	NC_015942	TGC	2	6	69373	69378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198300
1504	NC_015942	CTG	2	6	69384	69389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198300
1505	NC_015942	TTGG	2	8	69396	69403	0 %	50 %	50 %	0 %	344198300
1506	NC_015942	AGT	2	6	69432	69437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198300
1507	NC_015942	GC	3	6	69440	69445	0 %	0 %	50 %	50 %	344198300
1508	NC_015942	CGC	3	9	69443	69451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198300
1509	NC_015942	CTCA	2	8	69465	69472	25 %	25 %	0 %	50 %	344198300
1510	NC_015942	TC	3	6	69521	69526	0 %	50 %	0 %	50 %	344198300
1511	NC_015942	CGC	2	6	69689	69694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198300
1512	NC_015942	TGG	2	6	69709	69714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198300
1513	NC_015942	GGCG	2	8	69803	69810	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_015942	AGTA	2	8	69860	69867	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_015942	ACTA	2	8	69875	69882	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1516	NC_015942	TAT	2	6	69971	69976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198301
1517	NC_015942	TTG	2	6	69988	69993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198301
1518	NC_015942	CCG	2	6	70024	70029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198301
1519	NC_015942	ACC	2	6	70074	70079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198301
1520	NC_015942	TAAG	2	8	70087	70094	50 %	25 %	25 %	0 %	344198301
1521	NC_015942	GTA	2	6	70125	70130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198301
1522	NC_015942	CTG	2	6	70167	70172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198301
1523	NC_015942	ATC	2	6	70240	70245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198301
1524	NC_015942	CCA	2	6	70306	70311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198301
1525	NC_015942	AT	3	6	70370	70375	50 %	50 %	0 %	0 %	344198301
1526	NC_015942	ACT	2	6	70419	70424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198301
1527	NC_015942	TGC	2	6	70469	70474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198301
1528	NC_015942	CAA	2	6	70479	70484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198301
1529	NC_015942	TAT	2	6	70487	70492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198301
1530	NC_015942	CGAA	2	8	70504	70511	50 %	0 %	25 %	25 %	344198301
1531	NC_015942	CAA	2	6	70520	70525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198301
1532	NC_015942	ATA	2	6	70602	70607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198301
1533	NC_015942	GGT	2	6	70635	70640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198301
1534	NC_015942	CAC	2	6	70700	70705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198301
1535	NC_015942	CAC	2	6	70718	70723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198301
1536	NC_015942	GTA	2	6	70755	70760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198301
1537	NC_015942	CT	3	6	70791	70796	0 %	50 %	0 %	50 %	344198301
1538	NC_015942	ATT	2	6	70881	70886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198301
1539	NC_015942	ATT	2	6	70903	70908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198301
1540	NC_015942	AGT	2	6	70927	70932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198301
1541	NC_015942	ATG	2	6	70979	70984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198301
1542	NC_015942	CAT	2	6	70995	71000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198301
1543	NC_015942	GGT	2	6	71001	71006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198301
1544	NC_015942	ACC	2	6	71115	71120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198301
1545	NC_015942	AGA	2	6	71130	71135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198301
1546	NC_015942	AGT	2	6	71174	71179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198301
1547	NC_015942	GAA	2	6	71214	71219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198301
1548	NC_015942	A	6	6	71268	71273	100 %	0 %	0 %	0 %	344198301
1549	NC_015942	AAT	2	6	71284	71289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198301
1550	NC_015942	AG	3	6	71362	71367	50 %	0 %	50 %	0 %	344198302
1551	NC_015942	GTTC	2	8	71399	71406	0 %	50 %	25 %	25 %	344198302
1552	NC_015942	GAA	2	6	71456	71461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198302
1553	NC_015942	CAT	2	6	71523	71528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198302
1554	NC_015942	ACA	2	6	71571	71576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198302
1555	NC_015942	CATC	2	8	71628	71635	25 %	25 %	0 %	50 %	344198302
1556	NC_015942	TTA	2	6	71651	71656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198302
1557	NC_015942	CAA	2	6	71739	71744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198302
1558	NC_015942	AAG	2	6	71908	71913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198302
1559	NC_015942	TGC	2	6	71916	71921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198302
1560	NC_015942	TTA	2	6	72036	72041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198302
1561	NC_015942	TAA	2	6	72173	72178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198303
1562	NC_015942	AT	3	6	72180	72185	50 %	50 %	0 %	0 %	344198303
1563	NC_015942	CGA	2	6	72230	72235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198303
1564	NC_015942	ATA	2	6	72401	72406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198303
1565	NC_015942	TGC	2	6	72435	72440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198303
1566	NC_015942	TGT	2	6	72540	72545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198303
1567	NC_015942	AT	3	6	72607	72612	50 %	50 %	0 %	0 %	344198303
1568	NC_015942	AATA	2	8	72719	72726	75 %	25 %	0 %	0 %	344198303
1569	NC_015942	A	6	6	72760	72765	100 %	0 %	0 %	0 %	344198303
1570	NC_015942	AGA	2	6	72850	72855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198303
1571	NC_015942	ATA	2	6	72880	72885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198303
1572	NC_015942	TA	3	6	72927	72932	50 %	50 %	0 %	0 %	344198303
1573	NC_015942	GAT	2	6	72958	72963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198303
1574	NC_015942	TCG	2	6	72968	72973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198303
1575	NC_015942	TCTGA	2	10	73010	73019	20 %	40 %	20 %	20 %	344198303
1576	NC_015942	AAT	2	6	73051	73056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_015942	ATC	3	9	73067	73075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_015942	TAA	3	9	73080	73088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_015942	TAC	2	6	73106	73111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_015942	TGC	2	6	73134	73139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198304
1581	NC_015942	T	6	6	73186	73191	0 %	100 %	0 %	0 %	344198304
1582	NC_015942	CTG	2	6	73196	73201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198304
1583	NC_015942	TG	3	6	73275	73280	0 %	50 %	50 %	0 %	344198304
1584	NC_015942	TG	3	6	73310	73315	0 %	50 %	50 %	0 %	344198304
1585	NC_015942	AGG	2	6	73398	73403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198304
1586	NC_015942	TAT	2	6	73412	73417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198304
1587	NC_015942	CCG	2	6	73615	73620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198304
1588	NC_015942	CTT	2	6	73643	73648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198304
1589	NC_015942	CAT	2	6	73653	73658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198304
1590	NC_015942	CTTG	2	8	73677	73684	0 %	50 %	25 %	25 %	344198304
1591	NC_015942	TTG	2	6	73696	73701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198304
1592	NC_015942	T	6	6	73761	73766	0 %	100 %	0 %	0 %	344198304
1593	NC_015942	TAC	2	6	73782	73787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198304
1594	NC_015942	T	6	6	73845	73850	0 %	100 %	0 %	0 %	344198304
1595	NC_015942	TTTG	2	8	73899	73906	0 %	75 %	25 %	0 %	344198304
1596	NC_015942	GGC	2	6	73914	73919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198304
1597	NC_015942	ACA	2	6	73945	73950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198304
1598	NC_015942	ACA	2	6	74083	74088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198304
1599	NC_015942	TTCT	2	8	74141	74148	0 %	75 %	0 %	25 %	344198304
1600	NC_015942	TGTT	2	8	74154	74161	0 %	75 %	25 %	0 %	344198304
1601	NC_015942	CAT	3	9	74226	74234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198304
1602	NC_015942	GC	3	6	74246	74251	0 %	0 %	50 %	50 %	344198304
1603	NC_015942	GTAT	2	8	74361	74368	25 %	50 %	25 %	0 %	344198304
1604	NC_015942	GGCG	2	8	74418	74425	0 %	0 %	75 %	25 %	344198304
1605	NC_015942	TGC	2	6	74427	74432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198304
1606	NC_015942	CCAGC	2	10	74533	74542	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1607	NC_015942	ATG	3	9	74578	74586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_015942	CGC	2	6	74635	74640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1609	NC_015942	CCA	2	6	74718	74723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_015942	TC	3	6	74909	74914	0 %	50 %	0 %	50 %	344198305
1611	NC_015942	ATA	2	6	74917	74922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198305
1612	NC_015942	CATTT	2	10	74937	74946	20 %	60 %	0 %	20 %	344198305
1613	NC_015942	ATG	2	6	74974	74979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198305
1614	NC_015942	CAT	2	6	74983	74988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198305
1615	NC_015942	GATA	2	8	75178	75185	50 %	25 %	25 %	0 %	344198306
1616	NC_015942	CAG	2	6	75189	75194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198306
1617	NC_015942	CTG	2	6	75255	75260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198306
1618	NC_015942	GATC	2	8	75302	75309	25 %	25 %	25 %	25 %	344198306
1619	NC_015942	CCGTCG	2	12	75368	75379	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344198306
1620	NC_015942	CTG	2	6	75426	75431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198306
1621	NC_015942	CCA	2	6	75557	75562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198306
1622	NC_015942	G	6	6	75599	75604	0 %	0 %	100 %	0 %	344198306
1623	NC_015942	GAT	2	6	75633	75638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198306
1624	NC_015942	GCC	2	6	75697	75702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198306
1625	NC_015942	CGC	2	6	75723	75728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198306
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1878	NC_015942	GGCG	2	8	88441	88448	0 %	0 %	75 %	25 %	344198315
1879	NC_015942	CGT	2	6	88492	88497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198315
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